More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1769 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  52.78 
 
 
1063 aa  1093    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1085 aa  2200    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  61.39 
 
 
1092 aa  1348    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 
1088 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 
1101 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 
1027 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 
1040 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 
1023 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 
1097 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 
1028 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 
1124 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 
1155 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
1114 aa  273  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 
1117 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 
1059 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
1071 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
1050 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
1036 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 
1177 aa  251  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 
1046 aa  251  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 
1079 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 
1063 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 
1071 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 
1068 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 
1047 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
1000 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 
1064 aa  244  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 
1051 aa  244  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 
1066 aa  244  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 
1047 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 
1060 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 
1038 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 
1023 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
994 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
1044 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 
1096 aa  238  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 
1010 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
1148 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 
1021 aa  235  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 
1132 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 
1043 aa  234  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
1080 aa  234  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 
1040 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
1072 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 
1059 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 
1115 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 
1059 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
1078 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  25.16 
 
 
977 aa  229  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 
1064 aa  229  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.3 
 
 
1063 aa  229  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 
1074 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 
1006 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 
1135 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 
1176 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 
1189 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
1006 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
1029 aa  224  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 
1004 aa  222  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
1038 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
986 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 
1039 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 
1038 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 
1166 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  23.87 
 
 
1028 aa  219  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 
1081 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
1084 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 
1122 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 
1070 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
1082 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 
1127 aa  218  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 
1081 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 
1154 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 
1152 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
1076 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
1189 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 
1161 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
984 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 
1051 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 
1076 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 
1030 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25 
 
 
1008 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 
979 aa  211  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 
1198 aa  210  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
1033 aa  208  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 
994 aa  207  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 
1014 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
1105 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 
1034 aa  206  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 
1050 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 
1010 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
1128 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 
1079 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
1028 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 
1016 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 
1153 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 
1137 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 
1052 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 
1005 aa  197  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 
1017 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>