More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5532 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  46.82 
 
 		 1063 aa  957    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1092 aa  2224    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  61.04 
 
 		 1085 aa  1374    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1040 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1155 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1046 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1050 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1101 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1074 aa  215  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 1166 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1079 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 1078 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1176 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1053 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 1093 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 1063 aa  205  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1050 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1021 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 1135 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 1105 aa  201  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 986 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1059 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1063 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1049 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  22.22 
 
 		 1058 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 994 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1060 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1140 aa  194  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1040 aa  191  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1011 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1044 aa  190  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1148 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 		 1153 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1081 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 1082 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 994 aa  181  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1059 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1154 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 992 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 1035 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1033 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1128 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1027 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 1177 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1023 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 1071 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1189 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 1041 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 1142 aa  168  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 1036 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1004 aa  167  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1016 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 1059 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  23.43 
 
 		 1065 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  23.41 
 
 		 1032 aa  164  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 1139 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  21.56 
 
 		 1068 aa  162  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1038 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  22.72 
 
 		 1115 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  22.47 
 
 		 1073 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  22.61 
 
 		 1065 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  39.81 
 
 		 1077 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 1096 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 		 1163 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  23.09 
 
 		 1086 aa  155  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  22.45 
 
 		 1075 aa  154  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1093 aa  152  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 1064 aa  152  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1076 aa  151  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1181 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  22.35 
 
 		 1150 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1127 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1006 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1014 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1076 aa  150  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1138 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1177 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1042 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1124 aa  148  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1102 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1160 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 1131 aa  147  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.86 
 
 		 1028 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1088 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1128 aa  147  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1117 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1020 aa  145  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1039 aa  145  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1023 aa  145  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 996 aa  145  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  22.96 
 
 		 1051 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  22.51 
 
 		 1025 aa  144  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1107 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1051 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1070 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1059 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1132 aa  141  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1106 aa  141  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  23.39 
 
 		 1111 aa  141  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1155 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>