More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05670 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  100 
 
 		 1025 aa  2057    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1084 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1068 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1047 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1071 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1065 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1031 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.33 
 
 		 1028 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.79 
 
 		 1065 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1059 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1043 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1040 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1064 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 1058 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1189 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1135 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1153 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1059 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1105 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1081 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1127 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1166 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1050 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1022 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1011 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1073 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1033 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1038 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 1093 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1169 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1051 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1078 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1038 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1074 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 1010 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1072 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1142 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1087 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1081 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1043 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1063 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1033 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1129 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1059 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1098 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1234 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 1032 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1138 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1138 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1163 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1041 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1101 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 1083 aa  333  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1063 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1039 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1036 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1107 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1081 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  27.88 
 
 		 1071 aa  322  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1147 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1115 aa  314  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1044 aa  313  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1099 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1165 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1071 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1153 aa  307  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1073 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 1051 aa  303  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1088 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1008 aa  295  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1098 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1027 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1102 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1116 aa  277  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1067 aa  263  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1088 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1186 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1176 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1087 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1161 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1021 aa  205  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 999 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 994 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1023 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1040 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1014 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1008 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 962 aa  195  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1043 aa  196  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.07 
 
 		 1019 aa  195  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1081 aa  195  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1012 aa  194  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  42.41 
 
 		 1035 aa  194  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1076 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1003 aa  190  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 979 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1120 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1040 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1003 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  23.95 
 
 		 1024 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>