More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0369 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  49.2 
 
 		 1087 aa  968    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  38.11 
 
 		 1059 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1234 aa  2511    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 		 1065 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  37.43 
 
 		 1081 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 1166 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1059 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  36.56 
 
 		 1083 aa  595  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  35.31 
 
 		 1058 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1073 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 1051 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1072 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 1105 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 1093 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1031 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1081 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1138 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1040 aa  503  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1073 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  33.06 
 
 		 1071 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1074 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 		 1028 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1135 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1038 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1165 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1142 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1043 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1022 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1147 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1063 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1129 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1063 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1153 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1043 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1068 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 1032 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1169 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1127 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1047 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.55 
 
 		 1065 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1067 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1163 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1064 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1099 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 		 1051 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1036 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1081 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1059 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1033 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1071 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1033 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1101 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1088 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.78 
 
 		 1010 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1115 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1107 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1138 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1137 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1078 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1041 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1039 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1050 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1186 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1153 aa  370  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1098 aa  370  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1011 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1098 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1027 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1044 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1088 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1008 aa  340  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.3 
 
 		 1025 aa  335  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1057 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1084 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1116 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1176 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 999 aa  269  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1046 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1053 aa  232  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1120 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 962 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1173 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1029 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1129 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1050 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 1041 aa  207  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1070 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1155 aa  206  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1024 aa  194  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1097 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1140 aa  191  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 1038 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1154 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1177 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1019 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1096 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>