More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0570 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  55.98 
 
 		 1163 aa  1152    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  55.95 
 
 		 1169 aa  1191    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1088 aa  2209    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 1105 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 1093 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1059 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  32.7 
 
 		 1071 aa  496  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.53 
 
 		 1058 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1081 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1065 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1051 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1165 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1135 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1074 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1043 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1022 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1038 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1153 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1166 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1147 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1142 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1127 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1137 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1063 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1073 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 1234 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1059 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1040 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1098 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1043 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1031 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1115 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1138 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1129 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1036 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1063 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1057 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.4 
 
 		 1032 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1071 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1098 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1138 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1059 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1047 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1073 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1081 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1041 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1033 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.98 
 
 		 1083 aa  348  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 1051 aa  347  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1039 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1087 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1064 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1101 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1068 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1067 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1102 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1116 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1033 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1072 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1078 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.72 
 
 		 1010 aa  328  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1153 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1008 aa  323  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1081 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1189 aa  317  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1044 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1099 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.59 
 
 		 1025 aa  294  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1084 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1027 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1088 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1071 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1011 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1107 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1176 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1040 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1129 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1066 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 1161 aa  214  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 962 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1050 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 1000 aa  207  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1037 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 1038 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 1028 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1155 aa  201  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 1038 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1038 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1155 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 1071 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1059 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1076 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 1181 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  24.37 
 
 		 977 aa  192  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 1008 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 1037 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>