More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3400 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1057 aa  2131    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1138 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  51.51 
 
 		 1116 aa  1035    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 1105 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1059 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 1093 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1065 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.44 
 
 		 1058 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.87 
 
 		 1071 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1163 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1135 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1022 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1088 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1137 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1127 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1115 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1033 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1036 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1169 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1051 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 1028 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1098 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1071 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1081 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1059 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1063 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1031 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1074 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1073 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1038 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1072 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1101 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 		 1083 aa  341  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1073 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1047 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1234 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1084 aa  334  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1147 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1038 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1129 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1040 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1189 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 1065 aa  329  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1098 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1050 aa  327  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1087 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1039 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1068 aa  323  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1081 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1142 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1063 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1064 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1043 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1153 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1166 aa  320  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1081 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1078 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1011 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1138 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1102 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1059 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1107 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1043 aa  297  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1099 aa  295  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1041 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 1051 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 1032 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1165 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1186 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1044 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.22 
 
 		 1025 aa  268  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1033 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1008 aa  256  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1067 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 		 1010 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1153 aa  248  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1088 aa  241  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1176 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1027 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1027 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1038 aa  201  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1037 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1161 aa  194  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1031 aa  194  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1008 aa  194  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1038 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1026 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1071 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1023 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1028 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1128 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 1168 aa  184  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1066 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1076 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  25 
 
 		 1018 aa  182  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 1082 aa  181  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1173 aa  180  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 986 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1042 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>