More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1098 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1065 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  37.99 
 
 		 1058 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1105 aa  2250    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  43.29 
 
 		 1059 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  70.09 
 
 		 1093 aa  1581    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1081 aa  656    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  39.25 
 
 		 1071 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 1051 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  38.88 
 
 		 1028 aa  623  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  36.49 
 
 		 1169 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  36.33 
 
 		 1074 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1163 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1059 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1040 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  37.02 
 
 		 1022 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1135 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1038 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1088 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1137 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1087 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  36.39 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1166 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 1047 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1081 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1115 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 1234 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1098 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1043 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1129 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  35.95 
 
 		 1031 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 1064 aa  523  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.72 
 
 		 1065 aa  523  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1165 aa  523  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1073 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1142 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1138 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1038 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1153 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1068 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1138 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1072 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  34.01 
 
 		 1051 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1071 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1063 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1071 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1098 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1147 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1127 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1059 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1057 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1073 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 1050 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1043 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1036 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  33.06 
 
 		 1083 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1033 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  32.6 
 
 		 1032 aa  473  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1081 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1041 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1078 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1116 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1102 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1067 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1101 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1044 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1153 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1039 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 1010 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1011 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1088 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1186 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1084 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1099 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1107 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1008 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.38 
 
 		 1025 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1027 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1176 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1050 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1038 aa  270  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1027 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1023 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1038 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1161 aa  265  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1079 aa  262  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1066 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1046 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1028 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1173 aa  251  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1124 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1128 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1040 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1155 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1152 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 		 1080 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1181 aa  241  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1155 aa  241  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>