More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  39.17 
 
 		 1059 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  67.44 
 
 		 1166 aa  1465    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  38.51 
 
 		 1087 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1059 aa  2134    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  38.11 
 
 		 1234 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  36.85 
 
 		 1081 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 1105 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1071 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  36.94 
 
 		 1065 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  37.25 
 
 		 1058 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1051 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 1093 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1073 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1072 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1040 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  36.63 
 
 		 1083 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1074 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1038 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1135 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1043 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.54 
 
 		 1028 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1063 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1059 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1129 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1147 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1033 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.36 
 
 		 1065 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 1153 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1071 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 1078 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  33.18 
 
 		 1071 aa  509  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1063 aa  509  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1022 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1142 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  36.37 
 
 		 1115 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1047 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1064 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1081 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1137 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1138 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1068 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1098 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  32.54 
 
 		 1032 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1101 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1033 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 1050 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1169 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1036 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1011 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.24 
 
 		 1010 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1127 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1165 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1081 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1041 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  32.16 
 
 		 1051 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1163 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1073 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1043 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1153 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1088 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1067 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1088 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1102 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1138 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1107 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1084 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1186 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1098 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1044 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1008 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1099 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1027 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.16 
 
 		 1025 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1057 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1176 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1116 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1066 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 962 aa  275  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 1037 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 989 aa  260  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1117 aa  254  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1128 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1028 aa  253  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1066 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1029 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1034 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 996 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1000 aa  250  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1023 aa  250  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1155 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 994 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1051 aa  244  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1119 aa  244  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1038 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1114 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1116 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>