More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0801 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1116 aa  2273    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  51.27 
 
 		 1057 aa  1046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1138 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 1105 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1059 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1093 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 		 1058 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.63 
 
 		 1071 aa  432  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1033 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1115 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.39 
 
 		 1028 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1137 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1031 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1098 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1129 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1127 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1163 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1135 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1051 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1074 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1040 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1059 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1063 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1169 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1036 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1022 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1072 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1068 aa  344  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1088 aa  344  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1142 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1081 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1073 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1081 aa  340  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1047 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1071 aa  337  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1071 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1101 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1153 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1081 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 1098 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1073 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1059 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1038 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1043 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 1083 aa  322  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1234 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1043 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1041 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1138 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  27.58 
 
 		 1065 aa  319  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 1032 aa  317  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1064 aa  317  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1087 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1033 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1189 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1050 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1063 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 1166 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1147 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  27.53 
 
 		 1051 aa  301  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 1078 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 1039 aa  298  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1102 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.89 
 
 		 1025 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1165 aa  291  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1107 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1011 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1186 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.53 
 
 		 1010 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1153 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1084 aa  270  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1008 aa  265  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1027 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1099 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1044 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1088 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1067 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1176 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1128 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1062 aa  188  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1010 aa  188  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1023 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1070 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 1080 aa  179  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 1181 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 1082 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1003 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  23.5 
 
 		 1035 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1060 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  25.03 
 
 		 1018 aa  173  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 962 aa  172  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 1000 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1037 aa  165  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 1013 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1066 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  22.8 
 
 		 1173 aa  161  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1155 aa  158  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  21.72 
 
 		 1168 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>