More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6729 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  37.52 
 
 		 1032 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  39.86 
 
 		 1135 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  56.07 
 
 		 1033 aa  1094    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  41.38 
 
 		 1022 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1036 aa  2091    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  41.49 
 
 		 1063 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1138 aa  612  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1147 aa  612  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  38.15 
 
 		 1073 aa  604  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1038 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1142 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 1153 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  36.83 
 
 		 1051 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 1165 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1059 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.77 
 
 		 1065 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1031 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1074 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 1105 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.8 
 
 		 1028 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1129 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1040 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 1058 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1093 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1065 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1059 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1166 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1051 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1059 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1067 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1169 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1102 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.55 
 
 		 1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1041 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1234 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1081 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1071 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1087 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1011 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1033 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1068 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 1098 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1043 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1081 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1127 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1101 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 1010 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1057 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1163 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1078 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1099 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1138 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1072 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1153 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1064 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1186 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1071 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1039 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1116 aa  347  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1081 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1050 aa  344  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1073 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1044 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1047 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1107 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 1083 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1008 aa  331  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1098 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29 
 
 		 1025 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1115 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1027 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1137 aa  287  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1176 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1088 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1084 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 1038 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1040 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1027 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1037 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1023 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1114 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 999 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 993 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1116 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 986 aa  227  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 1029 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1014 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 1026 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1028 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1039 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1140 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1132 aa  220  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1046 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1071 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1079 aa  217  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>