More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7182 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  39.27 
 
 		 1107 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1186 aa  2421    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  46.42 
 
 		 1102 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  39.03 
 
 		 1099 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1065 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1153 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1142 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 		 1058 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1127 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1059 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1051 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 1028 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1166 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1129 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1138 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1074 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1031 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.68 
 
 		 1065 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1033 aa  410  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1135 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1147 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1105 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1063 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1059 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1098 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1072 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1041 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1101 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1043 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1068 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1189 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1063 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1093 aa  390  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 1051 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1081 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1087 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1040 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1165 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1163 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1064 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1043 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1071 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1137 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1071 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1033 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1234 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1073 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1073 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1038 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1059 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1078 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1036 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.71 
 
 		 1071 aa  360  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 1032 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1176 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1169 aa  353  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1081 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1022 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1081 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 1010 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1039 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1115 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1050 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.32 
 
 		 1083 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1088 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1047 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1153 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1098 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1044 aa  314  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1138 aa  309  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1067 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1160 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1008 aa  273  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1027 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1102 aa  271  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1120 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1116 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1161 aa  260  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1128 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1077 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1027 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1043 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1023 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.03 
 
 		 1024 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1155 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  26.03 
 
 		 1025 aa  253  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 1014 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1050 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1144 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1071 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1155 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1039 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 1037 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1177 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 999 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1124 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1097 aa  231  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1066 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1117 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>