More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1167 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1071 aa  2169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  66.45 
 
 		 1072 aa  1479    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1059 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1059 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 1166 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1234 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1065 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 		 1087 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1105 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1051 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1081 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1093 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 1040 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1074 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1129 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1059 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1073 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1068 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1083 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 1028 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1038 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1153 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1142 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1033 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1138 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1115 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 1058 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1127 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1031 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1047 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1043 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1135 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1063 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1063 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.51 
 
 		 1071 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1022 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1099 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1137 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1078 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1064 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1101 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 1065 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1071 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1073 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1102 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1081 aa  390  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1107 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1138 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1147 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 1050 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 1010 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1098 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1033 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1186 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 1039 aa  370  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 1051 aa  359  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1084 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1163 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1057 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1169 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1036 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 1032 aa  344  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1098 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1041 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1081 aa  324  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1008 aa  323  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1044 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1189 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1116 aa  314  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1153 aa  313  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1067 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.72 
 
 		 1025 aa  305  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1011 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1027 aa  297  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1088 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1176 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1070 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1088 aa  251  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1085 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1047 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1012 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1039 aa  237  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1114 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1137 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1097 aa  228  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1037 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1161 aa  227  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1066 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 999 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1082 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1079 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1023 aa  211  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 1063 aa  210  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1076 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1038 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1128 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1129 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>