More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0615 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  50.49 
 
 		 1137 aa  1037    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1098 aa  2224    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  51.68 
 
 		 1115 aa  1080    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  38.55 
 
 		 1081 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 1105 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1059 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 1093 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  35.75 
 
 		 1071 aa  495  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1065 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.01 
 
 		 1058 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1059 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 		 1038 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.3 
 
 		 1028 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1051 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 1135 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1166 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1040 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1068 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1074 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1022 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1153 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1127 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1043 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1142 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1063 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1064 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1038 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1081 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1078 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1063 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1073 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1088 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1147 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1071 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1129 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1043 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1163 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.73 
 
 		 1065 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1169 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1189 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1071 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1138 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1116 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1073 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1101 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1031 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1081 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1057 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1234 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1138 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1072 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1153 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1041 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1102 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1033 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1033 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 1010 aa  347  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1059 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1036 aa  343  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1039 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1107 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1011 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1098 aa  337  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1186 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 1032 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.4 
 
 		 1083 aa  330  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1099 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1067 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1044 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1027 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1088 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1176 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1008 aa  294  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.03 
 
 		 1025 aa  291  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1029 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1023 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1027 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1050 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 982 aa  254  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1040 aa  250  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1173 aa  248  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1050 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1025 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1161 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1122 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1155 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 986 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1081 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1181 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1177 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1114 aa  235  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1008 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1017 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1038 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1079 aa  231  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1066 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>