More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2043 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1028 aa  2066    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  42.95 
 
 		 1031 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  40.64 
 
 		 1063 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 1127 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  43.5 
 
 		 1129 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 1059 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  38.88 
 
 		 1105 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1059 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 1074 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 1098 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1038 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  37.52 
 
 		 1135 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1051 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 1093 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  36.76 
 
 		 1071 aa  568  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  35.26 
 
 		 1058 aa  562  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1063 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1065 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  36.7 
 
 		 1010 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  35.46 
 
 		 1051 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1138 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  36.53 
 
 		 1153 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  35.95 
 
 		 1043 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1041 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1022 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.73 
 
 		 1065 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1059 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1033 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1142 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1068 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1064 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1040 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1153 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 		 1169 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1147 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1008 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1047 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1033 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 1166 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1073 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1087 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1165 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1036 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 1234 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1081 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1071 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1102 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1081 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  33.43 
 
 		 1032 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1038 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1101 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1088 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1163 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1081 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1039 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1189 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1071 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1115 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1043 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 1078 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1072 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1098 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1067 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1073 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1011 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1050 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 		 1083 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1137 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1044 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  31.33 
 
 		 1025 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1027 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1099 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1138 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1116 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1107 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1088 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1176 aa  364  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1057 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1084 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 962 aa  327  7e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1114 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 986 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 1038 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 1030 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1000 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1037 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1023 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1046 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1117 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1053 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1050 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1008 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1040 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1129 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1102 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1034 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 1029 aa  261  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  27.19 
 
 		 977 aa  259  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 982 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>