More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04165 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 1105 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  38.84 
 
 		 1059 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  39.17 
 
 		 1093 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  100 
 
 		 1071 aa  2150    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  36.86 
 
 		 1028 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 1081 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.25 
 
 		 1058 aa  578  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1065 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1040 aa  552  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1051 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1115 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1163 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.45 
 
 		 1065 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1059 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  35.84 
 
 		 1137 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1169 aa  513  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1063 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1088 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1087 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1098 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 1234 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1074 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1138 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1129 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1135 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1165 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1166 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1138 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1073 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1043 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1127 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1038 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1033 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1022 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1153 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1068 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1063 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1064 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1081 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1072 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1043 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1071 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1059 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1031 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1057 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1071 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 1032 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1036 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1153 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  31.39 
 
 		 1051 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1147 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1142 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1116 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 		 1010 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 1050 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1041 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1081 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1073 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 1098 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1067 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1039 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1033 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1101 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1078 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1189 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1011 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1044 aa  363  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1027 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1102 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1186 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.53 
 
 		 1083 aa  358  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1099 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1088 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1008 aa  330  9e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.57 
 
 		 1025 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1107 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1084 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1176 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  26.38 
 
 		 977 aa  245  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 962 aa  241  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1173 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1028 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1062 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1040 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1066 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1034 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1017 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1046 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1043 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 999 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1064 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1129 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.03 
 
 		 1019 aa  204  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 996 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1038 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1028 aa  204  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1140 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1161 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>