More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4175 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  75.07 
 
 		 1107 aa  1710    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  39.03 
 
 		 1186 aa  781    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1102 aa  757    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1099 aa  2231    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1058 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1065 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1072 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1059 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1127 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1073 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1135 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1073 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1071 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1129 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1234 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1074 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.73 
 
 		 1065 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1081 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 1028 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1038 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1022 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1142 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1165 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1153 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1043 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1051 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1068 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1059 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1147 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1105 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1031 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1138 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1038 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1059 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1063 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1033 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.31 
 
 		 1032 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.51 
 
 		 1083 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1063 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1115 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1093 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1036 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1050 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1033 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1078 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1043 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1137 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1166 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1101 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1047 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1087 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1064 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1163 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1081 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 1051 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1071 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1040 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.1 
 
 		 1071 aa  348  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1189 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1081 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1044 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1041 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1039 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1169 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1027 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1153 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1098 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.79 
 
 		 1025 aa  315  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1088 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1088 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1098 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1011 aa  307  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.55 
 
 		 1010 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1057 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1138 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1084 aa  290  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1008 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1050 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1176 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1067 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1116 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1161 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1010 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1027 aa  237  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1037 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1079 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1066 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1026 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1076 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1039 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1028 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 999 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1070 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1071 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1120 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1051 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1064 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1155 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1010 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1053 aa  218  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>