More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6611 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1137 aa  2294    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  50.4 
 
 		 1098 aa  1014    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  71.75 
 
 		 1115 aa  1665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1081 aa  622  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1059 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1105 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1065 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1058 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1093 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  35.2 
 
 		 1071 aa  501  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1059 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1138 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 1166 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1078 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 		 1063 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1129 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1127 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1038 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1074 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1153 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1043 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.76 
 
 		 1028 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 1065 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1063 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1135 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1142 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1163 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1059 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1169 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1072 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1088 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1081 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1040 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1068 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1064 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1073 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1057 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1153 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1022 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1116 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1107 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1101 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1087 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1102 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1073 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1047 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 1051 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1234 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1050 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1031 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1147 aa  367  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1186 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.74 
 
 		 1010 aa  361  5e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1033 aa  361  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1098 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1165 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1071 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1088 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1099 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1067 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1083 aa  350  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1138 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1044 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1011 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 1032 aa  333  9e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1008 aa  330  9e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1081 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1033 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 1039 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1189 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1176 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1084 aa  297  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1027 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1036 aa  287  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1117 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1038 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1050 aa  254  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1128 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1017 aa  244  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 962 aa  239  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 996 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1066 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1122 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1008 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 1037 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1082 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1027 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  26 
 
 		 977 aa  233  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1029 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1161 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 1025 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1028 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 982 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1053 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1023 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>