More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1702 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  43.21 
 
 		 1088 aa  819    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1176 aa  2391    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1078 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1040 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1138 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1071 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1189 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1165 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1155 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1128 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1047 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1051 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1101 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1081 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1127 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1114 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1063 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1064 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 		 1028 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1059 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1098 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1142 aa  362  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1129 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1011 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1068 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1044 aa  358  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1097 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1186 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1105 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1166 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1189 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1065 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1117 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1153 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1153 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1059 aa  344  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1041 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 1083 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1043 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1102 aa  340  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1122 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1031 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1177 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1040 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 1058 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1059 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1198 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1148 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1115 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1169 aa  337  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1124 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1039 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1037 aa  337  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1093 aa  331  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1046 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1163 aa  327  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1177 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1081 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1081 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1073 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1038 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1074 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 1051 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1027 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1234 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1137 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1063 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1087 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1103 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1073 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1202 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 1144 aa  307  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 982 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1181 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 1043 aa  304  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1135 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1161 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1132 aa  302  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1098 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1033 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1163 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 1032 aa  300  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1152 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1079 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1008 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1129 aa  298  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1038 aa  297  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1179 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1029 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1036 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1155 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1147 aa  294  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1138 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 1010 aa  292  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1107 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1116 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1038 aa  290  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1173 aa  290  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>