More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0915 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1075 aa  2164    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1046 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1040 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1027 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1071 aa  230  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 994 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 999 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1047 aa  222  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1050 aa  221  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1088 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1066 aa  220  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 998 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 996 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1023 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 1037 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1161 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 1010 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1068 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 1027 aa  205  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1029 aa  204  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 1114 aa  201  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 1028 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1124 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1044 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1079 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 1028 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 982 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 986 aa  198  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  23.6 
 
 		 1019 aa  196  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1008 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1039 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1011 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 1014 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1120 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1078 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  24.94 
 
 		 1024 aa  191  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 1129 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1050 aa  188  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1096 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  24.32 
 
 		 1017 aa  187  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1013 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1040 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 1023 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1016 aa  183  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1076 aa  183  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 986 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1103 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1140 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1008 aa  180  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1006 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1076 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1098 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1173 aa  178  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 989 aa  177  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1038 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1059 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 1035 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 1043 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1038 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1076 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 1014 aa  173  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1169 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1106 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1135 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 1034 aa  171  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 1154 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1021 aa  168  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 994 aa  169  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 1065 aa  168  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1026 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  41.2 
 
 		 1147 aa  167  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1043 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1037 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 1071 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1177 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1022 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1023 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 1065 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1154 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1006 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 1019 aa  161  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 1094 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 1146 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1063 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 1032 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 1063 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1137 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  22.9 
 
 		 1036 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  22.85 
 
 		 1057 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1036 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1138 aa  157  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 976 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1023 aa  157  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 986 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1036 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1087 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1189 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 1039 aa  155  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>