More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1702 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  39.74 
 
 		 977 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1016 aa  2053    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 998 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 986 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1040 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1023 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1161 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1008 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1027 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1010 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1124 aa  282  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1006 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1046 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1177 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 1043 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1128 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1029 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1017 aa  264  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1013 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1177 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 1037 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 982 aa  258  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1144 aa  257  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 989 aa  257  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1006 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 1050 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1096 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1168 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1173 aa  250  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1047 aa  250  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1034 aa  250  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1040 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1006 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1155 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1051 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1008 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1181 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1129 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1120 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1012 aa  245  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1164 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1066 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 986 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 1071 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 986 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1023 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1073 aa  241  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1103 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1096 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1038 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1014 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 994 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1050 aa  237  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1024 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1068 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 1035 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 996 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1088 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1127 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 1039 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1116 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1073 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1155 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1012 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1039 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1059 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 979 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 1028 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1041 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1077 aa  231  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1028 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1114 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1025 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 976 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1038 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1033 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 1041 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.43 
 
 		 1024 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1051 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 996 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1135 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1014 aa  224  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1026 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1075 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 1032 aa  224  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1034 aa  224  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1076 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1059 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1076 aa  224  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 1047 aa  224  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1016 aa  224  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1119 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1059 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1021 aa  221  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1027 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1105 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1070 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1047 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1140 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 1063 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>