More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6126 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 986 aa  1985    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 998 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  34.8 
 
 		 977 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1016 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1040 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1008 aa  297  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1046 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 982 aa  284  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1161 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1029 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1043 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1039 aa  270  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1027 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1023 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1050 aa  267  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 		 1041 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1038 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1039 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1071 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1028 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1023 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1155 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1037 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1066 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1011 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 989 aa  252  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 999 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  26.2 
 
 		 1019 aa  250  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1173 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1120 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  24.84 
 
 		 1024 aa  247  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  24.78 
 
 		 1058 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1198 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1078 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1128 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1116 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1177 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1006 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1010 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1088 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1103 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 986 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1094 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1051 aa  231  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1181 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 1065 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1176 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1036 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1071 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1059 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 1079 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 1114 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1068 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1019 aa  223  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 1038 aa  220  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 994 aa  220  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1076 aa  220  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1044 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1047 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 996 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1097 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 997 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1040 aa  217  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1003 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1147 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 1028 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 1059 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1132 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1137 aa  214  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 1155 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1031 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 1034 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1135 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1071 aa  211  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1059 aa  211  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1150 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 992 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 984 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1051 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1063 aa  208  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1129 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 1025 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1004 aa  207  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 988 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1064 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 975 aa  205  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 986 aa  205  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1073 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1038 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 1032 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1023 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 976 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1154 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  25.2 
 
 		 925 aa  197  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1177 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 999 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1026 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 1011 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1137 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  23.65 
 
 		 1018 aa  193  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>