More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3773 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  38.38 
 
 		 1077 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 		 1100 aa  738    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1120 aa  2295    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1104 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1190 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1188 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1217 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1075 aa  579  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1045 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1064 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 1095 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1134 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1127 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1024 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1020 aa  370  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1019 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1036 aa  350  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1146 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1139 aa  345  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1082 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1012 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1038 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1034 aa  328  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1138 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1181 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1128 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1130 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1155 aa  317  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 1041 aa  317  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1161 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1117 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1114 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1076 aa  313  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 1038 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1000 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1050 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1142 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1147 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1152 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1006 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1177 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1119 aa  308  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1076 aa  308  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 989 aa  306  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1164 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1039 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1046 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1036 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1173 aa  300  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1122 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1003 aa  300  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1155 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1132 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1031 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1006 aa  297  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1028 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1008 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1034 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1124 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1079 aa  294  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1086 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1063 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1120 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 996 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1128 aa  292  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1037 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1051 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1047 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1154 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1103 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1075 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1189 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1066 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1008 aa  285  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 994 aa  284  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1062 aa  284  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1066 aa  284  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1129 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1164 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1123 aa  283  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1053 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1192 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1006 aa  280  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1056 aa  280  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1036 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1113 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1084 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1017 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1051 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1071 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1085 aa  277  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1079 aa  275  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1076 aa  273  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1093 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1147 aa  272  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1019 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1033 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1097 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1145 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1139 aa  271  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>