More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4139 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  49.7 
 
 		 1134 aa  1059    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1139 aa  2315    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  35.58 
 
 		 1095 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1217 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1188 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1190 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1064 aa  429  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1104 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1100 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1020 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1024 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1075 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1139 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1127 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1168 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1034 aa  353  8.999999999999999e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1146 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 1144 aa  340  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1084 aa  334  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1138 aa  334  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1051 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1189 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1038 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1095 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1046 aa  322  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1011 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1082 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1142 aa  314  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1079 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 1080 aa  309  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1063 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1036 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1033 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1202 aa  303  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1023 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1050 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1155 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1053 aa  302  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1047 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 993 aa  299  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1052 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1034 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1064 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1006 aa  294  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1148 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1059 aa  292  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1096 aa  292  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1053 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1070 aa  290  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1028 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1039 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1095 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1017 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1003 aa  287  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1033 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1137 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1168 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 1008 aa  283  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 996 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1014 aa  281  7e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1049 aa  279  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 1086 aa  279  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 1063 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1152 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1120 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1056 aa  268  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1080 aa  267  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1128 aa  267  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1077 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1119 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1027 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1103 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1048 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 994 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1106 aa  258  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1161 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1045 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1021 aa  250  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1128 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 976 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1031 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1038 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1130 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 1000 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1146 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1023 aa  232  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1059 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1057 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1023 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1085 aa  228  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1143 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 1123 aa  225  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1164 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1130 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  24.67 
 
 		 1111 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1019 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 		 1026 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1037 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1164 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1086 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>