More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4095 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
1123 aa  2299    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 
1042 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 
1058 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1048 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
1056 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 
1161 aa  316  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 
1079 aa  314  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
1037 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 
1020 aa  294  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 
1075 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 
1144 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 
1095 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 
1047 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
1038 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
1033 aa  287  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 
1148 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 
1094 aa  287  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 
1024 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 
996 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 
1049 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
996 aa  273  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 
1055 aa  273  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 
1139 aa  271  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 
989 aa  271  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 
1138 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 
1031 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 
1046 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 
1064 aa  270  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 
1164 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 
1188 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 
1028 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
994 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 
1131 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 
1150 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 
1036 aa  264  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 
1045 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 
1096 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 
1104 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 
1060 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 
1217 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 
986 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  27.57 
 
 
1018 aa  258  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 
1137 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 
1026 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 
1048 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 
1128 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
1152 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 
1132 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 
1117 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 
1142 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
1080 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 
1036 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 
1128 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 
1010 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
1086 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 
1095 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
1056 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 
1059 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 
1045 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
1065 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 
1027 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
1043 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 
1109 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 
999 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
1003 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 
1034 aa  241  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 
1114 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 
1087 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 
1154 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
1161 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 
975 aa  238  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 
1099 aa  237  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 
1074 aa  237  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
1061 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 
1005 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 
1062 aa  234  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
1023 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 
1036 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 
1086 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 
1148 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
1154 aa  228  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 
1029 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
953 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 
1017 aa  228  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 
1058 aa  226  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
993 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 
1094 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 
1037 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 
1145 aa  224  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 
1147 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
1079 aa  222  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 
1109 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
1081 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 
994 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 
1116 aa  218  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 
1034 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 
1068 aa  214  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 
1006 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 
1036 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 
1077 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>