More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3569 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  43.43 
 
 		 881 aa  646    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  44.61 
 
 		 772 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  44.24 
 
 		 790 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  44.54 
 
 		 793 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  44.36 
 
 		 775 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  50.71 
 
 		 792 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  58.55 
 
 		 814 aa  918    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  44.97 
 
 		 791 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 787 aa  1602    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  42.57 
 
 		 780 aa  626  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  42.04 
 
 		 775 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  42.41 
 
 		 800 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  42.84 
 
 		 791 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  39.82 
 
 		 872 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 		 923 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  39.72 
 
 		 803 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 806 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  36.63 
 
 		 928 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  36.54 
 
 		 917 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 789 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 804 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 852 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 874 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 875 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 772 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 753 aa  351  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 756 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.73 
 
 		 888 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 831 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.55 
 
 		 866 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 814 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.14 
 
 		 865 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  32.26 
 
 		 827 aa  91.7  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 792 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  29.39 
 
 		 791 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1056 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1062 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.65 
 
 		 906 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25.59 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1181 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1148 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 933 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 779 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1006 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1137 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.57 
 
 		 860 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 777 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  22.3 
 
 		 902 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 797 aa  77.4  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.42 
 
 		 859 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1142 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1079 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1102 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1028 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1095 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1165 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1129 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 986 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.69 
 
 		 848 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1127 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1104 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1062 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1020 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1051 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1135 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1115 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  31.5 
 
 		 859 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1084 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 798 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1102 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 735 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 833 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1027 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1100 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  40.34 
 
 		 924 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1107 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1101 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1099 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  27.23 
 
 		 821 aa  70.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  27.24 
 
 		 803 aa  70.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1046 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 1123 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.65 
 
 		 897 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1043 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  31.41 
 
 		 816 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 1050 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1023 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1088 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1051 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1175 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1036 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>