More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0707 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 848 aa  1754    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  40.27 
 
 		 833 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 778 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 763 aa  466  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 719 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 760 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 748 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 753 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 720 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 720 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  35.56 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  26.92 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 757 aa  125  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 798 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 745 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 734 aa  111  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 733 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  30.81 
 
 		 799 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 747 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1089 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 721 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 888 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 726 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 707 aa  102  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.34 
 
 		 633 aa  101  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  30.23 
 
 		 782 aa  101  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 791 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 668 aa  100  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 962 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.09 
 
 		 663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.09 
 
 		 663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.88 
 
 		 659 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 663 aa  97.8  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.93 
 
 		 663 aa  97.8  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.93 
 
 		 663 aa  97.8  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 713 aa  97.4  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.93 
 
 		 663 aa  97.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 836 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.13 
 
 		 641 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.41 
 
 		 807 aa  95.9  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 688 aa  95.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 799 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  36.76 
 
 		 677 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 772 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 933 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 893 aa  92  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 795 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 751 aa  91.3  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 691 aa  90.5  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 897 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.69 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 783 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 861 aa  88.6  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  33.08 
 
 		 687 aa  88.2  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 759 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1004 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1103 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 661 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 817 aa  85.1  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1128 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 649 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  29.67 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 845 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 824 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 955 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 943 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  32.05 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 807 aa  81.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 958 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 971 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 705 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 686 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 917 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1040 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>