More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4475 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  100 
 
 
955 aa  1941    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 
918 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 
971 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 
958 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 
1027 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 
929 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  39.55 
 
 
1001 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 
857 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
850 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
801 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
873 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 
1144 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 
779 aa  96.3  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
893 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
855 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 
1153 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
848 aa  92.8  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 
1142 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 
854 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 
1082 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 
1046 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1102 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
735 aa  90.1  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 
1074 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 
1041 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 
1107 aa  87.8  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1008 aa  85.9  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 
1058 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 
1059 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 
1064 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 
1083 aa  84.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 
1047 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 
1103 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 
776 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
780 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 
1148 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 
1019 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.84 
 
 
848 aa  82.8  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
1049 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 
1034 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 
1023 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.92 
 
 
1041 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 
1079 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 
1076 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 
1022 aa  81.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 
1130 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 
1038 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 
1102 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 
1119 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
763 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 
1011 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 
851 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
793 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 
1137 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 
1105 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 
1076 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 
1047 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1117 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 
1041 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 
747 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 
1057 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 
1059 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
1040 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 
1096 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
1036 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
1095 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 
748 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
754 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 
1039 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 
1064 aa  77.4  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 
1065 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.69 
 
 
833 aa  77  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
1102 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 
1065 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 
1053 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 
1062 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 
1036 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 
1027 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 
1127 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 
1084 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 
1115 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 
1186 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 
1043 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 
1177 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 
1063 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 
1119 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 
1031 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
1063 aa  75.1  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 
1059 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 
1137 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 
861 aa  74.3  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 
1043 aa  74.7  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 
1068 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 
1060 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 
1013 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 
1155 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 
1038 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
1014 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>