More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0569 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 778 aa  1588    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  37.02 
 
 		 848 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  35.71 
 
 		 833 aa  457  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 763 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 719 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 753 aa  174  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 748 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 750 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.37 
 
 		 640 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 720 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.04 
 
 		 633 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 720 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  24.17 
 
 		 720 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 720 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 734 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 918 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  23.63 
 
 		 726 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 634 aa  108  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 798 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 662 aa  101  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 680 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 747 aa  98.2  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 661 aa  98.2  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 828 aa  97.8  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 769 aa  97.4  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 		 676 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 649 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 845 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 836 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.88 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 924 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 893 aa  91.3  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  90.9  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.9 
 
 		 799 aa  90.9  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 657 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 815 aa  90.1  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.42 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 946 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.76 
 
 		 659 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.24 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 783 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 772 aa  88.2  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32.32 
 
 		 677 aa  88.2  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 663 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.72 
 
 		 663 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.72 
 
 		 663 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 745 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.08 
 
 		 641 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.72 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.72 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 691 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 919 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 795 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 757 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  30.53 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 791 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 933 aa  84.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 797 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 991 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.37 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 866 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 972 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 687 aa  82  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.51 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 947 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 917 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 1128 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.12 
 
 		 656 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  28.97 
 
 		 811 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  23.16 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.03 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.8 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  23.76 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.86 
 
 		 732 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 613 aa  77.8  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 817 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  29.05 
 
 		 807 aa  77  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>