More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1095 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 747 aa  1487    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 828 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.83 
 
 		 807 aa  184  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  39.56 
 
 		 893 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.65 
 
 		 638 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.26 
 
 		 650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.6 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.43 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.43 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 836 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 845 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 676 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 828 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.25 
 
 		 833 aa  124  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 783 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 748 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 815 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  21.87 
 
 		 750 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 760 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.89 
 
 		 666 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.89 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.89 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.89 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.51 
 
 		 666 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.56 
 
 		 665 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.17 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 679 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 776 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.52 
 
 		 619 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 702 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.65 
 
 		 848 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 763 aa  104  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1066 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 753 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 793 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 778 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 818 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.26 
 
 		 676 aa  101  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 642 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.47 
 
 		 640 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 769 aa  99  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 809 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 806 aa  97.8  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 801 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 1089 aa  98.2  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 754 aa  97.8  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  29.53 
 
 		 799 aa  97.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 810 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 655 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.76 
 
 		 712 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 753 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 662 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 666 aa  94.4  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 791 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 795 aa  94.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 763 aa  94  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 861 aa  94  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 848 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 788 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 957 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 624 aa  92.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 935 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  41.5 
 
 		 652 aa  91.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 817 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 626 aa  90.9  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 666 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 626 aa  90.9  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 640 aa  90.5  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 958 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 789 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  41.35 
 
 		 593 aa  90.5  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 824 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 772 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 757 aa  89.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 897 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.22 
 
 		 660 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 799 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 809 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  38.56 
 
 		 618 aa  89.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 617 aa  89.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 854 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 706 aa  89.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  25.22 
 
 		 660 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.62 
 
 		 698 aa  88.6  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  41.6 
 
 		 617 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 929 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 776 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1027 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 794 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 670 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.05 
 
 		 676 aa  88.2  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  24.05 
 
 		 676 aa  88.2  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  39.06 
 
 		 639 aa  87.8  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  31.25 
 
 		 782 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 799 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  24.05 
 
 		 676 aa  87.4  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>