More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0798 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1481    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  87.92 
 
 		 720 aa  1338    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  93.89 
 
 		 720 aa  1384    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  93.75 
 
 		 720 aa  1384    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 713 aa  342  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.51 
 
 		 833 aa  144  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 719 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.92 
 
 		 848 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 778 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  22.46 
 
 		 750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  21.52 
 
 		 753 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  22.1 
 
 		 748 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 734 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 661 aa  98.2  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  23.28 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.41 
 
 		 639 aa  91.3  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 760 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.21 
 
 		 661 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 		 659 aa  88.6  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.15 
 
 		 666 aa  88.6  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  32.06 
 
 		 611 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  19.81 
 
 		 773 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  21.3 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.16 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.03 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.96 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.41 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  20.96 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  24.74 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  35.83 
 
 		 620 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.03 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 649 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.85 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 691 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.38 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 634 aa  77.8  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 616 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.33 
 
 		 663 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  22.45 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.06 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 679 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.17 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.7 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.11 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  29.76 
 
 		 617 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.74 
 
 		 618 aa  73.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 653 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  20.98 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 653 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 681 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.29 
 
 		 631 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  22.15 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 597 aa  70.1  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.21 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  31.05 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.77 
 
 		 1023 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 675 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 662 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 698 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  25.54 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.08 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.44 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 907 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  29.63 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>