More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0565 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 613 aa  1263    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.03 
 
 		 633 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 634 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.27 
 
 		 659 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  29.78 
 
 		 639 aa  220  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.94 
 
 		 663 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.94 
 
 		 663 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.94 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.94 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.94 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 653 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.1 
 
 		 650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.11 
 
 		 641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  29.64 
 
 		 650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.64 
 
 		 650 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 635 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.48 
 
 		 650 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.33 
 
 		 650 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 657 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 648 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 649 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 707 aa  203  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.73 
 
 		 640 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.25 
 
 		 646 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 634 aa  197  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 653 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.48 
 
 		 653 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.54 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 642 aa  187  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1128 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 649 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  27.72 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 688 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 676 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.92 
 
 		 623 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 602 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 652 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.59 
 
 		 631 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 681 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.04 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 628 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 619 aa  163  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.34 
 
 		 656 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 740 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.51 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.31 
 
 		 616 aa  161  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 668 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.24 
 
 		 631 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 628 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.66 
 
 		 655 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 658 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 698 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 698 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 698 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 624 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 617 aa  154  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 627 aa  154  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 616 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 706 aa  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.27 
 
 		 613 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 665 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 714 aa  153  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 615 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.05 
 
 		 1023 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.24 
 
 		 615 aa  150  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.04 
 
 		 614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 679 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.11 
 
 		 665 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.04 
 
 		 614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.11 
 
 		 665 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.11 
 
 		 665 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 647 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 626 aa  147  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.89 
 
 		 652 aa  147  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.2 
 
 		 616 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 612 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.87 
 
 		 614 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 627 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.87 
 
 		 614 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.86 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.87 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 593 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.46 
 
 		 622 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 626 aa  144  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.91 
 
 		 614 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.91 
 
 		 614 aa  144  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.91 
 
 		 614 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.91 
 
 		 614 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.91 
 
 		 614 aa  143  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  27.44 
 
 		 611 aa  143  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  26.15 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 695 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  24.36 
 
 		 656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 690 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>