More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0975 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 806 aa  1647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  45.34 
 
 		 810 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  63.29 
 
 		 816 aa  1063    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  51.48 
 
 		 809 aa  824    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  44.17 
 
 		 808 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  40.75 
 
 		 810 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  39.45 
 
 		 907 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 		 795 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  38.61 
 
 		 786 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  40.91 
 
 		 789 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 852 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 785 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 782 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  36.76 
 
 		 769 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 767 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 812 aa  280  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 791 aa  260  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 814 aa  241  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 809 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 824 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 850 aa  230  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 789 aa  227  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 859 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 794 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 793 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 786 aa  204  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.18 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 862 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 805 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 807 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 864 aa  187  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  26.95 
 
 		 691 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 815 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 860 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 806 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 742 aa  181  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.6 
 
 		 801 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 837 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 781 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.5 
 
 		 708 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 825 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 689 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 734 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 730 aa  167  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 715 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 766 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 711 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 738 aa  163  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 723 aa  163  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.35 
 
 		 713 aa  162  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.71 
 
 		 713 aa  161  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 743 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.07 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.83 
 
 		 703 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 742 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 713 aa  159  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 713 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 726 aa  158  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 767 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 748 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 748 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 720 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 720 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 742 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 738 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 741 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.9 
 
 		 703 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 714 aa  155  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 749 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 714 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 736 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 732 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 696 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 770 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 705 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 794 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.59 
 
 		 696 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 737 aa  153  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 769 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 820 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 710 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 712 aa  151  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 709 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 726 aa  150  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 701 aa  150  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>