More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0983 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  88.69 
 
 		 715 aa  1294    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  81.14 
 
 		 720 aa  1195    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  81.41 
 
 		 720 aa  1199    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  53.03 
 
 		 702 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  97.93 
 
 		 724 aa  1419    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  97.1 
 
 		 724 aa  1409    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  53.03 
 
 		 702 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  81.14 
 
 		 720 aa  1199    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 723 aa  1470    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  81.42 
 
 		 714 aa  1201    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  81.14 
 
 		 720 aa  1194    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  43.76 
 
 		 720 aa  615  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  41.01 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 707 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  41.97 
 
 		 699 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  38.33 
 
 		 689 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.94 
 
 		 712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  37.15 
 
 		 703 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  37.55 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  39.19 
 
 		 713 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 		 722 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 757 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 701 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 701 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  37 
 
 		 703 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 		 701 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 722 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 		 701 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 710 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.73 
 
 		 696 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 708 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.63 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 710 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.33 
 
 		 711 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 692 aa  361  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 711 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 741 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 708 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 736 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 715 aa  343  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 689 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 714 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 710 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.31 
 
 		 709 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 722 aa  333  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 730 aa  333  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 738 aa  326  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 689 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 		 850 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 837 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 825 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 825 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 843 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 815 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.87 
 
 		 706 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 859 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 862 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 705 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 817 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 707 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 864 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 721 aa  258  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 713 aa  254  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 749 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.03 
 
 		 713 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.99 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 730 aa  250  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 740 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 810 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 714 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 738 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 677 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 829 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 796 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 742 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 742 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 742 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 712 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 881 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 881 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 882 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 737 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 921 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 921 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 796 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 796 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 863 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 796 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>