More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1044 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  88.84 
 
 
715 aa  1297    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  81.16 
 
 
720 aa  1196    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  81.3 
 
 
720 aa  1192    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  81.3 
 
 
720 aa  1194    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  81.59 
 
 
714 aa  1203    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  81.44 
 
 
720 aa  1196    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  52.76 
 
 
702 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  98.76 
 
 
724 aa  1456    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
724 aa  1472    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  52.76 
 
 
702 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  97.1 
 
 
723 aa  1432    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  44.32 
 
 
720 aa  618  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  41.14 
 
 
720 aa  525  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 
707 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  42.86 
 
 
699 aa  512  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  38.36 
 
 
689 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  37.1 
 
 
703 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  38.53 
 
 
712 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  38.46 
 
 
708 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.66 
 
 
713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 
701 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
757 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 
722 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  36.29 
 
 
701 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  37.64 
 
 
703 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 
722 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 
701 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 
701 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 
701 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 
709 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 
701 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.01 
 
 
710 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.87 
 
 
696 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
696 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
701 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.53 
 
 
703 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 
703 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
708 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 
734 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
692 aa  363  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 
710 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
741 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.18 
 
 
711 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
711 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
736 aa  349  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 
732 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 
689 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 
708 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
715 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 
714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 
722 aa  336  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 
710 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 
738 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.01 
 
 
709 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 
730 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
689 aa  317  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 
850 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
837 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
843 aa  287  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
825 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
825 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
815 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
817 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 
862 aa  266  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
859 aa  266  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
721 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 
707 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 
864 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.69 
 
 
706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 
713 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
714 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
714 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
677 aa  253  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.28 
 
 
713 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.7 
 
 
713 aa  251  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 
730 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 
749 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 
740 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 
829 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 
796 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
748 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
748 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
738 aa  244  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
742 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
742 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
719 aa  242  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
742 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
796 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
810 aa  240  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 
796 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
881 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
881 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
796 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 
860 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 
882 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
799 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
921 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
921 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>