More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3917 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
730 aa  1485    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  69.26 
 
 
767 aa  1005    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 
821 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5897  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
705 aa  344  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 
829 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  35.14 
 
 
799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 
778 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
819 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
733 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
837 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 
799 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 
745 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
710 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
719 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
701 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
723 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
721 aa  306  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
748 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 
831 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 
713 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
797 aa  299  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
779 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
829 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 
769 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 
794 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 
820 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 
757 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 
753 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
722 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
771 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
717 aa  290  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  33.71 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.26 
 
 
703 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.69 
 
 
708 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
717 aa  287  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 
708 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.62 
 
 
801 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
817 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.06 
 
 
833 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
828 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
696 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
797 aa  282  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
771 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
722 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
733 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
710 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 
860 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 
828 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
806 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
828 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
709 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
738 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
752 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.67 
 
 
797 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  31.36 
 
 
808 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
736 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
736 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
741 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  30.82 
 
 
753 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  30.82 
 
 
753 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 
812 aa  269  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 
737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 
692 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 
750 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.44 
 
 
806 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
729 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
745 aa  264  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
754 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
747 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
729 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
711 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 
828 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.59 
 
 
711 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
850 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
734 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 
701 aa  260  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
713 aa  260  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  30.72 
 
 
729 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
776 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
750 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.01 
 
 
752 aa  259  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 
784 aa  259  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 
734 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 
791 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
817 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  32.41 
 
 
728 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  31.8 
 
 
747 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
753 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
696 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
706 aa  258  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 
701 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
706 aa  258  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
794 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.55 
 
 
703 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  31.51 
 
 
747 aa  256  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 
789 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 
810 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.72 
 
 
696 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>