More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1499 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  61.64 
 
 		 744 aa  840    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  53.51 
 
 		 750 aa  737    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  63.67 
 
 		 745 aa  895    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  61.35 
 
 		 744 aa  840    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 747 aa  1505    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  42.63 
 
 		 815 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  44.41 
 
 		 754 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 829 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 		 769 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  40.14 
 
 		 801 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 806 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.59 
 
 		 833 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  38.38 
 
 		 729 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 745 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  36.46 
 
 		 808 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 		 771 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 		 821 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  39.82 
 
 		 771 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 		 733 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  36.71 
 
 		 719 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  38.22 
 
 		 819 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 753 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 		 738 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 741 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 812 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  36.95 
 
 		 753 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 		 745 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  36.95 
 
 		 753 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.33 
 
 		 778 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 737 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 752 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  38.62 
 
 		 789 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  35.58 
 
 		 740 aa  419  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 753 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 750 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 750 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  33.86 
 
 		 718 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 738 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 		 829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  36.3 
 
 		 747 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 799 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  35.98 
 
 		 747 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 		 734 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.73 
 
 		 806 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  35.57 
 
 		 729 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.45 
 
 		 808 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 714 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  35.98 
 
 		 747 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  37.09 
 
 		 729 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 717 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  35.84 
 
 		 747 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  36.8 
 
 		 729 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 740 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 754 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 		 750 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  35.94 
 
 		 745 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 754 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.65 
 
 		 797 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 754 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 729 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  36.02 
 
 		 747 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  35.44 
 
 		 752 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 785 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 785 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  35.72 
 
 		 729 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 		 737 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  35.72 
 
 		 703 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 831 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  35.98 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 748 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  35.72 
 
 		 703 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 810 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  34.89 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.34 
 
 		 794 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 735 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 784 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 817 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  34.05 
 
 		 719 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 820 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 725 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  35.93 
 
 		 822 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.56 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 863 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  34.34 
 
 		 726 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 		 810 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 729 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>