More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2881 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  64.85 
 
 		 633 aa  766    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 821 aa  1678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  67.12 
 
 		 819 aa  1045    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 829 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  42.73 
 
 		 829 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  41.21 
 
 		 808 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 		 778 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.79 
 
 		 833 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  39.58 
 
 		 815 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  40.58 
 
 		 801 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  39.95 
 
 		 799 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  39.92 
 
 		 812 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  41.29 
 
 		 769 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  41.98 
 
 		 729 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 863 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  39.01 
 
 		 806 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  39.42 
 
 		 831 aa  482  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 799 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  40.97 
 
 		 771 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  38.45 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  40.82 
 
 		 771 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 748 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 		 802 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 817 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  38.25 
 
 		 729 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  37.84 
 
 		 729 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 808 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.84 
 
 		 797 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  38.19 
 
 		 703 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  38.05 
 
 		 729 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  38.19 
 
 		 703 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  38.19 
 
 		 747 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 828 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.24 
 
 		 752 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  38.01 
 
 		 747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.7 
 
 		 806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  37.45 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  37.3 
 
 		 747 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  37.3 
 
 		 747 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  37.55 
 
 		 745 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 828 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 828 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 810 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 		 737 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 822 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  38.41 
 
 		 738 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  37.32 
 
 		 747 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  38.05 
 
 		 753 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  38.05 
 
 		 753 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  39.27 
 
 		 745 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  38.96 
 
 		 733 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 736 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 741 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 		 745 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  40.77 
 
 		 723 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 752 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  38.12 
 
 		 745 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 736 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 828 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 747 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 734 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  37.3 
 
 		 747 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 797 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  39.54 
 
 		 719 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 779 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 791 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 810 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  35.52 
 
 		 791 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 		 789 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  38.63 
 
 		 750 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 794 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 		 714 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 753 aa  426  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 750 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 794 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 754 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 750 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  37.43 
 
 		 747 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 754 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 733 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 735 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 820 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  37.81 
 
 		 753 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  37.11 
 
 		 740 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  38.44 
 
 		 776 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 797 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 754 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 877 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 754 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  37.34 
 
 		 729 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  36.95 
 
 		 696 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  34.09 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 717 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 		 728 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>