More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3294 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  72.27 
 
 		 708 aa  1050    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  71.19 
 
 		 709 aa  1015    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 711 aa  1454    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  93.39 
 
 		 710 aa  1333    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  80.59 
 
 		 708 aa  1198    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  58.22 
 
 		 710 aa  812    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  72.41 
 
 		 711 aa  1064    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  46.2 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  47.28 
 
 		 722 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  48.32 
 
 		 730 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 		 715 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  43.04 
 
 		 703 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  42.24 
 
 		 708 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  43.24 
 
 		 696 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 		 709 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 696 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  42.84 
 
 		 703 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  42.92 
 
 		 701 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.79 
 
 		 703 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 734 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  43.2 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 738 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  40.76 
 
 		 736 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 		 689 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  40.85 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  39.16 
 
 		 689 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 		 701 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 722 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  38.19 
 
 		 710 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  39.52 
 
 		 689 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  38.85 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 757 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 701 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  37.48 
 
 		 701 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 701 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 723 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.68 
 
 		 713 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 720 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 860 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 720 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 720 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 720 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 702 aa  343  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 702 aa  343  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 850 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 726 aa  337  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 837 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 843 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 726 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 743 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 862 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 720 aa  310  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 864 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 727 aa  306  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 815 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.2 
 
 		 806 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.62 
 
 		 797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 726 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 720 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 707 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 799 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 817 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 859 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 707 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 721 aa  290  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  30.66 
 
 		 699 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 796 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 809 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 821 aa  286  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 708 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.63 
 
 		 833 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.04 
 
 		 724 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 778 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 795 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 795 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 806 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 802 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 810 aa  277  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 766 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 808 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 705 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 719 aa  275  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 726 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  29.38 
 
 		 747 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>