More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2232 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  74.3 
 
 
711 aa  1098    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  59.3 
 
 
710 aa  826    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  71.95 
 
 
709 aa  1046    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  80.59 
 
 
711 aa  1176    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  81.5 
 
 
710 aa  1186    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
708 aa  1447    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  72.33 
 
 
708 aa  1069    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  45.71 
 
 
708 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  45.57 
 
 
703 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  46.24 
 
 
741 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  46.72 
 
 
722 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  46.91 
 
 
696 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  46.91 
 
 
696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  48.03 
 
 
730 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  47.63 
 
 
715 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 
709 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  45.01 
 
 
703 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  44.56 
 
 
701 aa  572  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 
692 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.97 
 
 
703 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  43.38 
 
 
734 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  40.79 
 
 
738 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 
732 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  41.22 
 
 
736 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 
689 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  41.16 
 
 
714 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 
701 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  40.09 
 
 
689 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  40.67 
 
 
689 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 
701 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 
701 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  40.32 
 
 
701 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  40.21 
 
 
710 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  39.54 
 
 
703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  36.75 
 
 
722 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 
757 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
722 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  38.94 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 
712 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
724 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
723 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
724 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
714 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 
860 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.32 
 
 
713 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
715 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 
850 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
720 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
720 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 
720 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
720 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 
837 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
726 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
702 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
702 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 
726 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
743 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
843 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 
862 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
825 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 
864 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
825 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 
726 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
815 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
859 aa  323  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 
720 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
799 aa  319  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.62 
 
 
806 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  31.42 
 
 
699 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
720 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 
707 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
821 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
817 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.43 
 
 
797 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 
727 aa  312  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
809 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
707 aa  300  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
796 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 
796 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
796 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
796 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.31 
 
 
833 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.76 
 
 
747 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 
808 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.62 
 
 
747 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.05 
 
 
795 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
766 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 
730 aa  286  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
778 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.93 
 
 
801 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 
806 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.05 
 
 
795 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 
770 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 
710 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 
820 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
721 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 
810 aa  282  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>