More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3135 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 734 aa  1463    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  80.06 
 
 		 736 aa  1145    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  76.12 
 
 		 738 aa  1087    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  78.21 
 
 		 714 aa  1100    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  77.54 
 
 		 689 aa  1040    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  79.17 
 
 		 732 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  69.26 
 
 		 689 aa  940    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  45.31 
 
 		 708 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  44.62 
 
 		 703 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 703 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  44.21 
 
 		 703 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  44.63 
 
 		 709 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  45.1 
 
 		 696 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 696 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  42.98 
 
 		 701 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  43.38 
 
 		 708 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  42.5 
 
 		 741 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  44.4 
 
 		 722 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.02 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  43.16 
 
 		 710 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  43.93 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  41.34 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  44.48 
 
 		 730 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  41.26 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 710 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 757 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  41.53 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 701 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  42.07 
 
 		 703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  41.64 
 
 		 722 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  39.5 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  39.31 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  42.37 
 
 		 722 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  39.17 
 
 		 701 aa  439  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  39.17 
 
 		 701 aa  439  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  36.76 
 
 		 712 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 701 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 860 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 		 710 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 843 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 		 723 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 817 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 862 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 864 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.59 
 
 		 713 aa  353  8.999999999999999e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 720 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 720 aa  349  9e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 720 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 720 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 720 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 		 837 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 726 aa  336  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 726 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 850 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 743 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 815 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 825 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 825 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 859 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 707 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 821 aa  297  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  29.99 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 819 aa  289  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 707 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 829 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 707 aa  280  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 745 aa  273  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 829 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 796 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 726 aa  270  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 796 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 720 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 708 aa  267  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 710 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 719 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 694 aa  260  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 721 aa  259  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.21 
 
 		 713 aa  259  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.21 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 767 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 710 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 770 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 858 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 795 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 719 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 715 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>