More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3640 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  69.26 
 
 		 730 aa  1015    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 767 aa  1566    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 821 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 		 819 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 733 aa  331  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 829 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 745 aa  323  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 723 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5897  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 705 aa  314  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 799 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 778 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 769 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 831 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  34.11 
 
 		 799 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 837 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 717 aa  300  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 717 aa  299  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 721 aa  294  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 713 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 		 719 aa  293  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 779 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 797 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 748 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.47 
 
 		 801 aa  281  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 696 aa  280  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 771 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 753 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 733 aa  275  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 701 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 812 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.07 
 
 		 708 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 806 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 817 aa  270  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.28 
 
 		 808 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 771 aa  267  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.65 
 
 		 729 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 754 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.97 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 689 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.62 
 
 		 691 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.21 
 
 		 833 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 734 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 738 aa  258  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 745 aa  257  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 794 aa  257  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 722 aa  255  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 709 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 776 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 701 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  30.33 
 
 		 791 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 794 aa  250  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 757 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 860 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 784 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 715 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 747 aa  249  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 701 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 820 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  29.46 
 
 		 753 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 737 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  29.46 
 
 		 753 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 741 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 701 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 736 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 701 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 736 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 815 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 703 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 817 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 863 aa  244  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 717 aa  243  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 701 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 735 aa  243  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 738 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.05 
 
 		 797 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 828 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  30.27 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 736 aa  242  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 828 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 850 aa  241  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 750 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.03 
 
 		 806 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 754 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 802 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 754 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 732 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  28.93 
 
 		 747 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 750 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 699 aa  238  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>