More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2415 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  64.64 
 
 
729 aa  997    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  53.77 
 
 
801 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  48.43 
 
 
806 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  93.36 
 
 
741 aa  1387    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  93.77 
 
 
737 aa  1396    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  64.64 
 
 
729 aa  927    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  65.12 
 
 
725 aa  928    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  66.03 
 
 
729 aa  954    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  68.68 
 
 
750 aa  1023    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  69.01 
 
 
753 aa  1061    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
738 aa  1509    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  93.77 
 
 
753 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  68.67 
 
 
754 aa  1042    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  64.87 
 
 
725 aa  921    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  71.14 
 
 
745 aa  1095    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  68.53 
 
 
754 aa  1039    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  69.31 
 
 
750 aa  1068    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  93.36 
 
 
736 aa  1385    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  65.16 
 
 
729 aa  927    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  68.67 
 
 
754 aa  1042    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  93.36 
 
 
752 aa  1388    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  64.87 
 
 
725 aa  921    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  93.77 
 
 
753 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  71.51 
 
 
734 aa  1026    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  93.36 
 
 
736 aa  1385    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  40.27 
 
 
829 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.09 
 
 
833 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 
754 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.89 
 
 
797 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.33 
 
 
806 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 
810 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 
819 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  38.47 
 
 
808 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  38.13 
 
 
802 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.96 
 
 
821 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 
808 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
723 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 
778 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  38.09 
 
 
729 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 
748 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 
745 aa  436  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.94 
 
 
745 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 
740 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
810 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
815 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 
810 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 
799 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  36.75 
 
 
729 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 
745 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 
717 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 
747 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  36.95 
 
 
769 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 
810 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
701 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 
820 aa  416  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 
733 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 
828 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  35 
 
 
794 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
701 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
789 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 
744 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 
744 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 
817 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.86 
 
 
729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  33.6 
 
 
729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.12 
 
 
752 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 
750 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 
705 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  34.67 
 
 
747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  34.67 
 
 
747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.55 
 
 
729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.81 
 
 
747 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
735 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.81 
 
 
747 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.74 
 
 
703 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.74 
 
 
703 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.68 
 
 
747 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.81 
 
 
745 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  36.13 
 
 
747 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 
771 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
829 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 
719 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
771 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 
717 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 
797 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 
791 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
717 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  36.04 
 
 
791 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
747 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
696 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.81 
 
 
747 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  34.57 
 
 
696 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 
828 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  34.57 
 
 
696 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
799 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 
812 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  34.42 
 
 
696 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
831 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  34.08 
 
 
724 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  34.28 
 
 
698 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>