More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0008 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  48.21 
 
 
715 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  46.52 
 
 
716 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  49.38 
 
 
711 aa  715    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
713 aa  1470    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 
715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 
643 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  35.75 
 
 
729 aa  436  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  35.92 
 
 
729 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  35.27 
 
 
701 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
696 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 
705 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 
736 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  36.42 
 
 
703 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  36.42 
 
 
703 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  36.27 
 
 
729 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  36.22 
 
 
729 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.59 
 
 
833 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  36.18 
 
 
729 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
828 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.8 
 
 
752 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
828 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
828 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  33.47 
 
 
696 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.61 
 
 
696 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  35.25 
 
 
747 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  35.4 
 
 
747 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  35.4 
 
 
747 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.47 
 
 
696 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.42 
 
 
747 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.61 
 
 
696 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  35.25 
 
 
747 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
829 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.47 
 
 
698 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.93 
 
 
829 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  35.25 
 
 
747 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.34 
 
 
794 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 
700 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 
820 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  35.21 
 
 
745 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 
747 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.82 
 
 
747 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
797 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 
806 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.87 
 
 
806 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.49 
 
 
808 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 
789 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
705 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 
778 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
831 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
810 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.45 
 
 
801 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.23 
 
 
797 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 
808 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
810 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
726 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 
785 aa  352  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
810 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
785 aa  351  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
810 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
802 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
748 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
721 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
784 aa  347  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
828 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
740 aa  342  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.28 
 
 
689 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 
771 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 
817 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 
733 aa  340  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 
771 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 
714 aa  339  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 
701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
791 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.53 
 
 
791 aa  336  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 
735 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
797 aa  333  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 
717 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
750 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
799 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 
753 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 
769 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 
745 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
799 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
785 aa  324  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
719 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
822 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
729 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  31.56 
 
 
701 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
821 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 
738 aa  320  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  31.27 
 
 
718 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
717 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
717 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 
812 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  31.21 
 
 
753 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  31.21 
 
 
753 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 
737 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
699 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 
734 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 
733 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>