More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5897 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5897  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 705 aa  1451    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 730 aa  344  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 767 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 829 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 821 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 733 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 799 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 794 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 831 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 719 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 820 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 817 aa  258  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 819 aa  258  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 733 aa  257  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 740 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 769 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 705 aa  252  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 717 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 717 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 736 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.48 
 
 		 801 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  26.77 
 
 		 747 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 778 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.59 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 754 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 745 aa  242  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 717 aa  241  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 815 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 806 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  28.11 
 
 		 729 aa  237  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  27.22 
 
 		 729 aa  237  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 808 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  26.13 
 
 		 747 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  28.36 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  28.37 
 
 		 808 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.85 
 
 		 806 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 723 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  26 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.57 
 
 		 799 aa  234  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  25.94 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 750 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  28.49 
 
 		 719 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  25.94 
 
 		 747 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 810 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 745 aa  231  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 745 aa  231  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 747 aa  230  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  25.8 
 
 		 747 aa  230  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.9 
 
 		 833 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 815 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  25.74 
 
 		 745 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 754 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 810 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  28.03 
 
 		 718 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 729 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  29.13 
 
 		 696 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  27.06 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 771 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 734 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 810 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 771 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 799 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 810 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 696 aa  224  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 701 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 699 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  29.13 
 
 		 696 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 863 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 828 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 735 aa  224  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  29.13 
 
 		 698 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 791 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 745 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 829 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 721 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 747 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  26.07 
 
 		 747 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  27.88 
 
 		 699 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  27.3 
 
 		 728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  30.03 
 
 		 791 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.99 
 
 		 696 aa  220  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 828 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.99 
 
 		 696 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 738 aa  219  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  26.86 
 
 		 740 aa  217  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  26.64 
 
 		 753 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 752 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 713 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 736 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>