More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001284 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  64.65 
 
 		 718 aa  947    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  100 
 
 		 701 aa  1447    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  45.11 
 
 		 699 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 797 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 808 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0752  outer membrane ferric hydroxamate receptor FhuA  36.35 
 
 		 680 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.204803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 736 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  35.91 
 
 		 740 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.28 
 
 		 806 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 829 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 806 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.14 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 810 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 863 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  34.21 
 
 		 729 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 810 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 810 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.96 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  33.15 
 
 		 719 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 733 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 778 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 733 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 701 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  34.88 
 
 		 719 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 794 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 696 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 797 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  30.39 
 
 		 740 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 723 aa  356  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 828 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  35.29 
 
 		 696 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  33.92 
 
 		 808 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 829 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 820 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  35.29 
 
 		 696 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  35.14 
 
 		 696 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  35.14 
 
 		 698 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 721 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 828 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 828 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  33.68 
 
 		 729 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  352  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 726 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  34.11 
 
 		 729 aa  351  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 740 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.27 
 
 		 747 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.96 
 
 		 833 aa  350  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 815 aa  350  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  32.41 
 
 		 747 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.27 
 
 		 747 aa  349  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  34.86 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  32.41 
 
 		 747 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.27 
 
 		 747 aa  347  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  32.94 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  31.98 
 
 		 747 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.56 
 
 		 745 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 745 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  33.38 
 
 		 718 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  32.94 
 
 		 729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  32.84 
 
 		 703 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  32.84 
 
 		 703 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.56 
 
 		 752 aa  339  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 701 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  32.69 
 
 		 799 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  32.01 
 
 		 711 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 747 aa  336  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.41 
 
 		 747 aa  336  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 735 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  33.95 
 
 		 789 aa  330  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  31.91 
 
 		 733 aa  329  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 717 aa  328  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 812 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 799 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  32.14 
 
 		 716 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 665 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 771 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 745 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 713 aa  321  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 744 aa  320  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 771 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 744 aa  319  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 706 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 831 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 747 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 728 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 750 aa  316  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 728 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 769 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 717 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 738 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 719 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 779 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>