More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0946 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
706 aa  1456    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  60.33 
 
 
733 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  39.65 
 
 
745 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 
717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  39.63 
 
 
719 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  38.61 
 
 
717 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  38.06 
 
 
701 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 
728 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 
665 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 
728 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 
696 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 
829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.17 
 
 
806 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.71 
 
 
797 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 
733 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 
802 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 
812 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  37.11 
 
 
801 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
723 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.43 
 
 
833 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
808 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
799 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  33.52 
 
 
728 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
810 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
797 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 
828 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 
820 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 
794 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 
828 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 
710 aa  363  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 
829 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 
828 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 
810 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
810 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
810 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 
683 aa  353  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
806 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
817 aa  349  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 
717 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
797 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
701 aa  348  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
726 aa  347  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 
705 aa  346  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
735 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 
757 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  31.98 
 
 
696 aa  343  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
863 aa  343  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  31.98 
 
 
696 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  31.98 
 
 
696 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
752 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
741 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
736 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 
736 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
696 aa  339  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  34.46 
 
 
799 aa  339  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
721 aa  339  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  32.69 
 
 
753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  32.69 
 
 
753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  31.83 
 
 
698 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
714 aa  337  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  31.69 
 
 
696 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
779 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 
737 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.1 
 
 
729 aa  336  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  31.87 
 
 
808 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 
740 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
771 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
789 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 
736 aa  334  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
819 aa  333  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
754 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
738 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
778 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
699 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.5 
 
 
747 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 
771 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.42 
 
 
747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
815 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  30.47 
 
 
729 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  30.34 
 
 
729 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  29.61 
 
 
747 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 
727 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
821 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
799 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 
733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  30.3 
 
 
729 aa  321  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
753 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 
877 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 
776 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30.12 
 
 
729 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
791 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  31.72 
 
 
791 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
748 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  30.88 
 
 
701 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  30.68 
 
 
703 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30.68 
 
 
703 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
750 aa  318  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  29.61 
 
 
752 aa  318  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
724 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
769 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>