More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003321 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  50.62 
 
 		 715 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  51.05 
 
 		 716 aa  746    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  49.38 
 
 		 713 aa  715    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  100 
 
 		 711 aa  1467    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 		 643 aa  438  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 700 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.81 
 
 		 833 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  35.52 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 736 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  34.97 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.44 
 
 		 752 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.8 
 
 		 729 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  36.15 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  36.15 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.36 
 
 		 747 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.22 
 
 		 747 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  34.66 
 
 		 729 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.22 
 
 		 747 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  35.38 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.32 
 
 		 745 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  34.35 
 
 		 747 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  34.61 
 
 		 747 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 747 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.22 
 
 		 747 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 829 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.51 
 
 		 747 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 828 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 701 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 789 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 794 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 705 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 820 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 699 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.8 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 717 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.66 
 
 		 696 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  34.03 
 
 		 696 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.66 
 
 		 698 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  33.89 
 
 		 696 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.02 
 
 		 806 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 696 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 740 aa  362  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 797 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 810 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 806 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 808 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.48 
 
 		 797 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 831 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 705 aa  354  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 802 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 829 aa  353  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  33.38 
 
 		 808 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 778 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 721 aa  348  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 810 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 726 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 735 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 817 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 797 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 810 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.02 
 
 		 801 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  32.01 
 
 		 701 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 810 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  33.01 
 
 		 740 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 748 aa  330  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 745 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 769 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 727 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 733 aa  326  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 828 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 733 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 701 aa  323  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 753 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.47 
 
 		 689 aa  320  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 771 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 723 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 812 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 771 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 785 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 791 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 799 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 745 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 724 aa  313  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 744 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.33 
 
 		 791 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 785 aa  312  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 822 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  33.75 
 
 		 719 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 744 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 776 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 719 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 717 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  31.45 
 
 		 718 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 738 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>