More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0646 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  96.54 
 
 		 728 aa  1325    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  96.09 
 
 		 728 aa  1319    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 665 aa  1352    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  42.3 
 
 		 701 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  40.54 
 
 		 719 aa  459  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 		 745 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 717 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 717 aa  435  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 829 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.21 
 
 		 833 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 819 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  38.04 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  38.74 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  37.77 
 
 		 728 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 		 696 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.72 
 
 		 829 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 821 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 789 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 		 754 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.09 
 
 		 797 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.81 
 
 		 806 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 806 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 753 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 750 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  35.83 
 
 		 729 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 734 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 750 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  33.92 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 737 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 738 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 754 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  33.92 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  34.21 
 
 		 733 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 810 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 741 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  34.99 
 
 		 729 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 745 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  36.02 
 
 		 799 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 812 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 776 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  35.54 
 
 		 747 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 778 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 733 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 729 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 810 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  33.24 
 
 		 808 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  32.8 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.62 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  33.62 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  32.8 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  34.54 
 
 		 747 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  33.62 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 810 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 769 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 729 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 810 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 753 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 735 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  34.25 
 
 		 747 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 723 aa  353  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 750 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.68 
 
 		 747 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.53 
 
 		 747 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.53 
 
 		 747 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 725 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 		 745 aa  349  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.34 
 
 		 745 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 717 aa  346  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  33.57 
 
 		 752 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.59 
 
 		 689 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 748 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 799 aa  344  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 785 aa  343  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 771 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 785 aa  342  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 		 747 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.53 
 
 		 747 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 750 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 		 784 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 729 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 820 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 		 828 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 744 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 771 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 779 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 744 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>