More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4121 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  95.41 
 
 		 784 aa  1496    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 785 aa  1570    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  73.98 
 
 		 785 aa  1122    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  99.62 
 
 		 785 aa  1566    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.68 
 
 		 833 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 		 715 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 		 789 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  37.72 
 
 		 753 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 829 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 828 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 750 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 828 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  35.68 
 
 		 729 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 		 828 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.33 
 
 		 689 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 820 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 829 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 705 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.91 
 
 		 806 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 736 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.04 
 
 		 729 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.54 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  32.53 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  32.7 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 747 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.83 
 
 		 821 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 819 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 		 748 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  33.7 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  33.7 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 771 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.73 
 
 		 729 aa  386  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 877 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  36.97 
 
 		 771 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.04 
 
 		 747 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 745 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 723 aa  379  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 808 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.04 
 
 		 747 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.92 
 
 		 747 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.88 
 
 		 745 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 747 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.92 
 
 		 747 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  33.96 
 
 		 808 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 705 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 757 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 696 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.87 
 
 		 747 aa  365  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 		 799 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 		 810 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 714 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.05 
 
 		 747 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 806 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.05 
 
 		 747 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 810 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 769 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.57 
 
 		 696 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.57 
 
 		 696 aa  360  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.66 
 
 		 752 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 737 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.43 
 
 		 696 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 733 aa  357  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 728 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 776 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 802 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.66 
 
 		 698 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 728 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  33.52 
 
 		 696 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 713 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 738 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 743 aa  350  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 		 815 aa  350  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 757 aa  350  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 		 831 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 810 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  33.97 
 
 		 740 aa  346  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 744 aa  346  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 817 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 754 aa  344  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 810 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 799 aa  344  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 744 aa  343  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.42 
 
 		 801 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.36 
 
 		 753 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.36 
 
 		 753 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 665 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 736 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 737 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 736 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 752 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 741 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>