More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2875 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  60.33 
 
 		 706 aa  872    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  100 
 
 		 733 aa  1513    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 717 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  38.74 
 
 		 745 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 717 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 		 719 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 701 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 723 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 		 799 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 733 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.2 
 
 		 801 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  35.82 
 
 		 701 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 665 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 728 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.91 
 
 		 806 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 728 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.82 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 705 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 710 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.81 
 
 		 696 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.81 
 
 		 696 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.81 
 
 		 696 aa  363  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  34.65 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  33.24 
 
 		 696 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.66 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 829 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 797 aa  356  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  33.09 
 
 		 728 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 828 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 808 aa  350  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 828 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 829 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 828 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 683 aa  347  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 794 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 810 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 721 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 820 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 797 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 863 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 738 aa  336  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 		 833 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  32.42 
 
 		 808 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 736 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 741 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 752 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 736 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  31.91 
 
 		 701 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 812 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  31.67 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 736 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  31.79 
 
 		 753 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  31.79 
 
 		 753 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 737 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 806 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 810 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.79 
 
 		 747 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 733 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  31.73 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  31.16 
 
 		 718 aa  318  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.5 
 
 		 747 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 877 aa  317  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 815 aa  316  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 778 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 745 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  31.73 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 724 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 799 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 734 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 831 aa  314  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 699 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  32.29 
 
 		 791 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  31.14 
 
 		 703 aa  313  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  31.14 
 
 		 703 aa  313  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 810 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 791 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.97 
 
 		 799 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 810 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 714 aa  313  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30.99 
 
 		 729 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 735 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.36 
 
 		 747 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.22 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  30.53 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 819 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.22 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 753 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 771 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.17 
 
 		 745 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 750 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 754 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 747 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 821 aa  304  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 754 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 784 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>